Determinación de polimorfismos en los genes de los miR-494, miR-155, miR-144 miR-17, miR-663, miR-4505 y su correlación con trastorno de ansiedad generalizada en una muestra de Bogotá, Colombia
The aim of this work was to determine if there is an association between a single nucleotide polymorphism of the genes of miR-494, miR-155, miR-144-3p and miR-17, miR663 and miR-4505, with the diagnosis of generalized anxiety disorder (GAD) in a sample of participants from Bogotá, Colombia. Two grou...
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Formato: | Trabajo de grado (Pregrado y/o Especialización) |
Lenguaje: | spa |
Publicado: |
Universidad Antonio Nariño
2022
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Materias: | |
Acceso en línea: | http://repositorio.uan.edu.co/handle/123456789/7106 |
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author | Zamora Gomez, Santiago |
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description | The aim of this work was to determine if there is an association between a single nucleotide polymorphism of the genes of miR-494, miR-155, miR-144-3p and miR-17, miR663 and miR-4505, with the diagnosis of generalized anxiety disorder (GAD) in a sample of participants from Bogotá, Colombia. Two groups of participants were classified according to the scores obtained from two scales: the Hospital Anxiety and Depression Survey (HADS), and the Zung Self-Assessment Scale for Anxiety; those who exceeded the cut-off point of the two scales were classified as GAD group and those who scored below the cutoff were classified as control. For the search of the SNPs in proposed miRNA genes, we used databases such as miRNASNP-v3 and PubMed. Reports in the literature provided information about the frequency with which these SNPs occur in the Latin American population. Additionally, we identified genes regulated by the miRNAs with ToppFun and TarBase v.8, and some of the functions. Most SNPs have frequencies less than 0.1, making it impossible to genotype some of them due to the low probability of finding them in the studied population. As an alternative, the rs1452789 (A/T) in the TCF4 gene was genotyped and it was found that this SNP does not present a significant association as a risk factor for GAD. |
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institution | Repositorio Digital UAN |
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spelling | repositorio.uan.edu.co-123456789-71062024-10-09T22:55:48Z Determinación de polimorfismos en los genes de los miR-494, miR-155, miR-144 miR-17, miR-663, miR-4505 y su correlación con trastorno de ansiedad generalizada en una muestra de Bogotá, Colombia Zamora Gomez, Santiago Trujillo Güiza, Martha Liliana González Giraldo, Yeimy SNP MicroRNAs Trastorno de ansiedad Polimorfismos Genética SNP miRNA Anxiety disorder Polymorphism Genetics The aim of this work was to determine if there is an association between a single nucleotide polymorphism of the genes of miR-494, miR-155, miR-144-3p and miR-17, miR663 and miR-4505, with the diagnosis of generalized anxiety disorder (GAD) in a sample of participants from Bogotá, Colombia. Two groups of participants were classified according to the scores obtained from two scales: the Hospital Anxiety and Depression Survey (HADS), and the Zung Self-Assessment Scale for Anxiety; those who exceeded the cut-off point of the two scales were classified as GAD group and those who scored below the cutoff were classified as control. For the search of the SNPs in proposed miRNA genes, we used databases such as miRNASNP-v3 and PubMed. Reports in the literature provided information about the frequency with which these SNPs occur in the Latin American population. Additionally, we identified genes regulated by the miRNAs with ToppFun and TarBase v.8, and some of the functions. Most SNPs have frequencies less than 0.1, making it impossible to genotype some of them due to the low probability of finding them in the studied population. As an alternative, the rs1452789 (A/T) in the TCF4 gene was genotyped and it was found that this SNP does not present a significant association as a risk factor for GAD. El objetivo de este trabajo fue determinar si existe asociación entre los polimorfismos de un solo nucleótido de los genes de los microRNAs miR-494, miR-155, miR-144-3p y miR17, miR-663 y miR-4505, con el diagnóstico de trastorno de ansiedad generalizada (TAG) en una muestra de personas de Bogotá, Colombia. Se originaron dos grupos de participantes, clasificándolos según los puntajes obtenidos de estas dos encuestas: la encuesta Hospitalaria de Ansiedad y Depresión (HADS), y la escala de autoevaluación para ansiedad de Zung; quienes sobrepasaron el punto de corte de las dos escalas se clasificaron como grupo TAG y aquellos que obtuvieron un puntaje por debajo al corte se clasificaron como control. Para la búsqueda de los SNPs presentes en genes de miRNA propuestos, se utilizaron bases de datos como miRNASNP-v3 y PubMed. Los reportes en la literatura proporcionaron información acerca de la frecuencia con la que estos se presentan en la población latinoamericana. Adicionalmente, con las herramientas ToppFun y TarBase v.8 se identificaron genes que son regulados por los miRNA y algunas de sus funciones. Se observó que la mayoría de los SNP presentan frecuencias menores a 0,1, imposibilitando la genotipificación de alguno por la bajas probabilidad de encontrarlo en la población estudiada. Como alternativa, se genotipificó el rs1452789 (A/T) del gen TCF4 y se encontró que este SNP no presenta una asociación significativa como un factor de riesgo para TAG Bioquímico(a) Pregrado Presencial 2022-10-12T16:50:59Z 2022-10-12T16:50:59Z 2022-07-08 Trabajo de grado (Pregrado y/o Especialización) info:eu-repo/semantics/acceptedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 http://repositorio.uan.edu.co/handle/123456789/7106 Aguilera, P., Tachiquín, M. R., Graciela, M., Munive, R., & Olvera, B. P. (2014). PCR en tiempo real. Herramientas Moleculares Aplicadas En Ecología: Aspectos Teóricos y Prácticos, 175–202 Arango, D. O. D., Subdirecto, R. V. R., María Fernanda De La Ossa Archila, J., Ortiz González Director Operativo DIMCE, M., Angélica Arrieta Romero, M., Alfonso Díaz Cruz, D., Andrea García Rojas, K., Felipe Gómez González Profesional especializado DIMCE Elaboración Natalia Alonso Ospina, D., Lizeth Chávez, K., Alexander Ramírez, C., Esteban Lara, N., Coral Director Técnico DIMPE, H., & Vega Directora Técnica DCD Diseño diagramación Gabriela Wiesner Montaño Cesar Rojas Lozano Brandon Steve Rojas Guerra Portada Francisco Viveros, A. (n.d.). DEPARTAMENTO ADMINISTRATIVO NACIONAL DE ESTADÍSTICA-DANE. Assmann, T. S., Duarte, G. C. K., Brondani, L. A., de Freitas, P. H. O., Martins, É. M., Canani, L. H., & Crispim, D. (2017). Polymorphisms in genes encoding miR-155 and miR-146a are associated with protection to type 1 diabetes mellitus. Acta Diabetologica, 54(5), 433–441. Ávila-Moreno, F., Urrea, F., & Ortiz-Quintero, B. (2011). MicroRNAs en el diagnóstico y prognosis del cáncer pulmonar. Revista de Investigación Clí}nica, 63(5), 516–535. Brzezinski, M., Michelotti, G. A., & Schwinn, D. A. (2006). Genomics and proteomics. Foundations of Anesthesia, 71–78. https://doi.org/10.1016/B978-0-323-03707-5.50011-5 Caratachea, M. A. C. (2007). Polimorfismos genéticos: Importancia y aplicaciones. Revista Del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, 20(3), 213–221 Chen, S., Sun, X., Niu, W., Kong, L., He, M., Fan, H., Li, W., Zhong, A., Zhang, L., & Lu, J. (2016). Correlation between the level of microRNA expression in peripheral blood mononuclear cells and symptomatology in patients with generalized anxiety disorder. Comprehensive Psychiatry, 69, 216–224. de Sousa, M., Gjorgjieva, M., Dolicka, D., Sobolewski, C., & Foti, M. (2019). Deciphering miRNAs’ action through miRNA editing. International Journal of Molecular Sciences, 20(24), 6249. Forero, D. A., Vélez-van-Meerbeke, A., Deshpande, S. N., Nicolini, H., & Perry, G. (2014). 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Revista Colombiana de Psiquiatria, 45, 147–153. instname:Universidad Antonio Nariño reponame:Repositorio Institucional UAN repourl:https://repositorio.uan.edu.co/ spa Acceso abierto Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0) https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ info:eu-repo/semantics/openAccess http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 application/pdf application/pdf application/pdf Universidad Antonio Nariño Bioquímica Facultad de Ciencias Bogotá - Circunvalar |
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